Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPB9F8W1W9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms