Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms