Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms