Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A8MVJ9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A8MVJ9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms