Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms