Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3CA6NKF2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms