Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL33A6NCF5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms