Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC162PA2VCL2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms