Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms