Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms