Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPG7Q9UQ90 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms