Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHOC2Q9UQ13 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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