Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms