Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms