Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS3Q9UNS2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms