Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms