Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms