Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms