Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms