Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms