Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms