Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCKIPSDQ9NZQ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms