Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms