Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBFOX1Q9NWB1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms