Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms