Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TDP1Q9NUW8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TDP1Q9NUW8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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