Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEPPQ9NTK1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms