Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms