Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms