Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX15Q9NRS6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms