Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOX2Q9NRD8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms