Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms