Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSU72Q9NP77 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms