Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIAA1549Q9HCM3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms