Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms