Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLMPQ9H6B4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLMPQ9H6B4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms