Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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