Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP2-4Q9BYR9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms