Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PECRQ9BY49 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms