Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms