Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BBS2Q9BXC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms