Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms