Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms