Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3R4Q99570 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms