Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms