Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB40CQ96S21 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40CQ96S21 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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