Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms