Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3IPQ96QF0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms