Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms