Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms